Mezi nepříznivé činitele ovlivňující negativně život v jezírku patří kromě jiných i výskyt škůdců. V zahradních jezírkách lze za škůdce považovat několik druhů brouků a jejich larvy, hmyz, rostlinní paraziti a v neposlední řadě volavky, pro něž jsou ryby v zahradním jezírku pochoutkou.
Škodlivý hmyz – kolem jezírka se vždy vyskytuje větší množství hmyzu, který různými způsoby škodí rybám a rostlinám, ale tak to v přírodě chodí a poškození jsou v podstatě zanedbatelná. Nesmí však dojít k nerovnováze (pokud se určitý druh hmyzu přemnoží), pak je třeba zasáhnout.
Brouci a jejich larvy – zvláštní pozornost je třeba si dávat např. na ploštice, nebo na potápníka vroubeného (jde o nenasytného predátora, který svými silnými kusadly napadá ryby. Jeho larva je dokonce ještě dravější). Brouků a ploštic je těžké se zbavit, ale větší hrozbou pro ryby v jezírku jsou larvy např. larva vážek (napadají ryby i větší, než je sama).
Pijavky - mají zploštělé tělo a přísavky na obou koncích těla. Do jezírka se může přenést buď jako již vyvinutý jedinec, nebo v podobě vajíčka. Pijavky sají krev a zanechávají ranky, které ryby oslabují a vystavují dalším infekcím. Prostředky proti těmto parazitům jsou dnes běžně dostupné.
Kapřivci – mají zploštělé oválné tělo kryté pevným průhledným širokým hřbetním štítem, tzv. parazitičtí korýši, kteří se přichycují pomocí přísavek na rybí kůži, nebo se do ní zavrtávají. Kapřivci sají krev a mohou způsobit značná poranění. Pokud je ryba napadena, má se vyndat a kapřivce pinzetou sundat, poté se doporučuje rybku vrátit do jezírka s dezinfekcí (metylénovou modří).
Rostlinní škůdci – vodní rostliny, zvláště lekníny, mohou být zamořené larvami hmyzích škůdců, nebo mšicemi. Pokud je jezírko dobře osázené rybami, nebývají škody na leknínech významné a není třeba zvlášť zasahovat (ryby škůdce s oblibou pojídají).